domingo, 11 de septiembre de 2016

Estrategias para recuperar información
Resumen: Juan Alberto Gutiérrez Sendejas
La recuperación de la información también es llamada búsqueda, la RI es el campo aplicado a la adquisición, organización y búsqueda de la información basada en el conocimiento. Debido al gran avance en la RI en cuanto a las tecnologías, las bibliotecas también han cambiado su visión por lo que hoy en día hay muchas bibliotecas virtuales.
El objetivo general de la RI es encontrar contenido que cumpla las necesidades de información de una persona, esto se hace mediante el inicio de una consulta en el sistema, un buscador equipara la consulta con elementos del contenido mediante los metadatos que son datos acerca de datos., además de esto se incluyen los procesos intelectuales indexación (asignar metadatos a los elementos del contenido) y la recuperación (el ingreso de la consulta)
La información basada en el conocimiento, se divide en dos la información primaria (información basada en el conocimiento primario) y la información secundaria (información primaria sintetizada).
Contenido: este se clasifica en contenido bibliográfico (bases de datos bibliográficas), contenido de texto completo (versiones en línea de libros y publicaciones periodísticas), contenido comentado (bases de datos de imágenes, de datos genómicos, de referencia y de MBE) y acumulados del contenido.
Indexación: es el proceso de asignar metadatos al contenido para facilitar su recuperación y se hace de dos formas la manual y la automática, la indexación está regida por protocolos y terminologías.

Recuperación: hay dos estrategias para la recuperación de la información, por concordancia exacta que se refiere a que al usuario se le otorga el control preciso de los elementos encontrados y la concordancia parcial, que intenta devolverle al usuario contenido de acuerdo a la cercanía de su búsqueda.
Bibliografía: Mendiola, Gustavo  Informática Biomédica. México D.F. Elservier 2014 

viernes, 2 de septiembre de 2016

CASO CLÍNICO
Elaborado por: Juan Alberto Gutiérrez Sendejas  
Se trata de un varón de 53 años fumador de más de 30 cigarrillos al día sin cumplir criterios de bronquitis crónica, consumidor excesivo de alcohol y diabetes tipo 2 diagnosticada cuatro años antes de su asistencia en Urgencias, no realizando seguimiento ni tratamiento alguno. Disponemos de una última hemoglobina glicada (HbA1c) de 8.5%. Como antecedentes familiares tiene un padre con DM en tratamiento con insulina. Trabajaba en estructuras metálicas y actualmente se encuentra en paro laboral, motivo por el cual había incrementado su consumo de alcohol. Es traído por su familia por importante deterioro del estado general, astenia intensa, hiporexia y polidipsia extrema sin focalidad infecciosa de al menos 2 semanas de evolución. Dos o tres días previos al ingreso se añade al cuadro somnolencia y desorientación espacio-temporal. Refiere pérdida de peso no cuantificada. Niega consumo excesivo de alcohol u otros tóxicos durante el periodo de deterioro clínico. Además de la corrección hidroelectrolítica y de la insulinización intensiva, el paciente requirió sedación por agitación psicomotriz en probable relación con deprivación alcohólica. En pocos días se consigue una mejoría de los parámetros bioquímicos. Una vez en planta se objetiva en analítica Triglicéridos (TG) 12.320 mg/dL y Colesterol (CT) 1170 mg/dL (HDL 78 mg/dL; LDL 180 mg/dL). Tras optimización del perfil glucémico a los pocos días se observa un descenso marcado de los lípidos. 11 11 Exploración física - Fenotipo normal. Peso 76,200 kg, Talla 168 cm, IMC 27 kg/m2 , TA 100/65 mmHg, SatO2 97%, Tª 36,4ºC. Consciente y orientado. Colaborador. Bien hidratado, nutrido y perfundido. Normal coloración de piel y mucosas. Plétora facial. Eupneico. - Cabeza y cuello: pares craneales conservados. Diastema. No bocio palpable. - Auscultación cardio-pulmonar: normal - Abdomen: pequeña hernia umbilical reductible. Blando y depresible a la palpación. Globuloso. Ruidos hidroaéreos normales. No puntos dolorosos. - EEII: no edemas ni signos de TVP. Pies de arquitectura normal. Buena temperatura y coloración. No heridas ni úlceras. Pruebas complementarias - Analítica al ingreso: Glucemia 680 mg/dL, Na 131 meq/L, K 2,7 meq/L, Urea 114 mg/dL, pH 7,32, HCO3- 15 mmol/L, Creatinina 4 mg/dL, Colesterol (CT) 1170 mg/dL (HDL 78 mg/dL; LDL 180 mg/dL), Triglicéridos 12320 mg/dL, Osmolalidad 320 mOsm/ kg, Hemoglobina 10 g/dL, VCM 95 fl, HCM 32.7 Pg, Plaquetas 475000, Leucocitos 11.190 (fórmula normal). Vitamina B12 925 pg/mL, Ácido Fólico > 24 ng/mL. HbA1c 21,30%. Péptido C basal 1,92 ng/mL (0,78-1,89), Péptido C tras glucagón 3,11 ng/mL. Paucialbuminuria 10,2 mg/L. TSH 1,76 mcU/mL. - Sistemático: densidad 1014. Leucocitos 25 cel/mcl. Nitritos negativos. PH 7. Cuerpos cetónicos 5. Glucosa 1000 mg/dL. Urobilinógeno normal. Bilirrubina negativo. Hematíes 50 cel/mcl. Sedimento (microscopía): levaduras frecuentes. Hematíes 23 cel/µL. Células epiteliales de vías bajas 11 cel/µL. Bacterias 360 cel/µL (tras sondaje vesical) - Radiografía de tórax: sin hallazgos patológicos de interés. - ECG: ritmo sinusal normal. Alteraciones inespecíficas de la repolarización. - TAC craneal: no se aprecia imagen de sangrado activo. Lesión hipodensa < 1 cm en tálamo derecho en probable relación con infarto lacunar antiguo. Megacisterna magna. EVOLUCIÓN Y DISCUSIÓN El pobre control metabólico durante años por abandono u omisión de tratamiento en pacientes diabéticos desemboca, inexorablemente, en complicaciones agudas como el caso que nos ocupa. Nos hallamos ante un síndrome hiperosmolar con deshidratación debido al déficit relativo de insulina y estimulación de hormonas contrarreguladoras, asociado a insuficiencia renal aguda. La normalización en pocos días de la función renal con adecuada reposición de volumen apoya el origen prerrenal de la disfunción. En los antecedentes se indica que se trata de un bebedor excesivo de alcohol, rasgo que podemos confirmar en la analítica (anemia con rasgos macrosómicos) y en la evolución en urgencias (probable síndrome de abstinencia alcohólica). La hiperlipidemia tan marcada (colesterol de perfil no LDL, no HDL, hipertrigliceridemia severa) podría relacionarse con el consumo excesivo de alcohol o bien ser secundario a un mal control glucémico (dislipemia diabética). La evolución en planta y su seguimiento en consultas, sugieren la segunda hipótesis o bien tratarse de una combinación de las dos causas. 12 Al alta se instaura tratamiento con insulina aspártica mezcla (30/70), metformina y fenofibratos, así como recomendaciones para modificaciones del estilo de vida y abandono del consumo etílico, manteniendo un buen control metabólico durante los cuatro años de seguimiento en consultas (ver evolución en tabla 1). Llama la atención la favorable y rápida respuesta del descenso de lípidos (en pocos días) tras el inicio de la insulinización. La DM con insulinresistencia asocia efectos conocidos sobre el metabolismo de los lípidos y los quilomicrones. Algunos estudios sugieren que un inadecuado estilo de vida y el hiperinsulinismo asociado a la resistencia a la insulina son los principales factores patogénicos. Otros autores confirman que la adiposidad visceral y la resistencia a la insulina constituyen la base de la fisiopatología, muy ligada al síndrome X o síndrome metabólico. Esta denominada dislipemia diabética se relaciona con ateroesclerosis acelerada en pacientes mal controlados debido a un incremento en la producción de VLDL a nivel hepático. En tejidos periféricos, como el músculo o tejido adiposo, existe una disminución de la actividad de la enzima lipoproteínlipasa (LPL), lo que conlleva a un aumento de ácidos grasos (AG) libres y glicerol que estimulan en hígado la liberación de TG y VLDL y la sobreproducción de apo-B que se relaciona así mismo con la resistencia a la insulina. A nivel plasmático, se produce una acumulación de VLDL, IDL y LDL, así como un descenso de HDL, creando por tanto un entorno proaterogénico. La aterogenicidad de las partículas LDL de la dislipemia diabética, más pequeñas y densas, se atribuye a su mayor susceptibilidad a la oxidación y mayor penetración en la pared de los vasos, pero en muchos pacientes pueden constituir un marcador de insulinresistencia o de presencia de VLDL aterogénica. Por otro lado, recientemente, se ha propuesto que la homeostasis del colesterol es importante para una correcta función de las células beta. La acumulación de colesterol en las células beta, causada por una HDL con captación defectuosa de colesterol, induce alteración de la secreción de insulina, hiperglicemia y apoptois de las células beta. Varios estudios han demostrado que una terapia hipolipemiante en pacientes diabéticos tipo 2 reduce considerablemente el número de eventos cardiovasculares (estatinas 22-50%, fibratos en torno al 65% en comparación con placebo).
PREGUNTAS ESTRUCTURA PICO
1.     ¿Qué tratamiento se tiene que dar ante las complicaciones del paciente, que nunca a tenido tratamiento aluno?
2.     ¿es viable aplicar insulina, ante la presencia de insuficiencia renal?
3.     ¿Qué hacer si hay resistencia a la insulina?
4.     ¿es preciso aplicar una terapia hipolipemiante?

5.     ¿Se tendría que dar medicamento para reducir el colesterol y así controlar la producción de insulina?

lunes, 22 de agosto de 2016

JERARQUIA DEL CONOCIMIENTO
“DIKW”
Gutiérrez Sendejas Juan Alberto

La jerarquía del conocimiento DIKW(data, information, kenowledge, wisdom) , es una estratificación del como se llega a la sabiduría empezando por cosas simples como los datos.
El dato se define como un símbolo producto de la observación y representa las propiedades de objetos, eventos y su entorno. Son la materia prima para construir información y pueden dividirse de la siguiente manera:
-         Datos narrativos: lo que dice el paciente
-         Datos numéricos: signos vitales
-         Imágenes: radiografías
La información es la suma de datos más significado,  esta permite responder a cuatro interrogantes para entender problemas y para la toma de decisiones (¿Qué, quién cuándo y cómo?). Los datos tienen que tener un proceso mental para asignarles significado y nos sean de ayuda.
El conocimiento es la síntesis de datos e información a los que se añade la capacidad cognitiva y la experiencia de cada individuo, para así transformarlos en soluciones (como solucionar).  El conocimientos se puede dividir en explícito y tácito, el primero se encuentra codificado (escrito) y se relaciona con el saber que, mientras que el segundo es de tipo subjetivo y es el saber cómo.

Por último la sabiduría que está en la cúspide de la pirámide y se refiere a la aplicación es decir a hacer y emplear todo la anterior para la toma de decisiones y solución de problemas, esta se logra a partir de la practica reflexiva.
Bibliografía: Mendiola, Gustavo  Informática Biomédica. México D.F. Elservier 2014 

domingo, 21 de agosto de 2016

Capítulo 2: Datos en medicina; su adquisición, almacenamiento y uso. Taxonomía de la información y el conocimiento.

Resumen: Juan Alberto Gutiérrez Sendejas
En medicina es de gran importancia entender el origen de la información, dado que una de las misiones más importantes de los médicos la toma de decisiones y la solución de problemas.
Dentro del área de la IB, hay algo conocido como “jerarquía de la información”, “pirámide del conocimiento” o “DICS”, este modelo es integrado por los conceptos de datos, información, conocimiento y sabiduría.
El dato se define como un símbolo producto de la observación y representa las propiedades de objetos, eventos y su entorno. Son la materia prima para construir información y pueden dividirse de la siguiente manera:
-         Datos narrativos: lo que dice el paciente
-         Datos numéricos: signos vitales
-         Imágenes: radiografías
La información es la suma de datos más significado,  esta permite responder a cuatro interrogantes para entender problemas y para la toma de decisiones (¿Qué, quién cuándo y cómo?). Los datos tienen que tener un proceso mental para asignarles significado y nos sean de ayuda.
El conocimiento es la síntesis de datos e información a los que se añade la capacidad cognitiva y la experiencia de cada individuo, para así transformarlos en soluciones (como solucionar).  El conocimientos se puede dividir en explícito y tácito, el primero se encuentra codificado (escrito) y se relaciona con el saber que, mientras que el segundo es de tipo subjetivo y es el saber cómo.

Por último la sabiduría que está en la cúspide de la pirámide y se refiere a la aplicación es decir a hacer y emplear todo la anterior para la toma de decisiones y solución de problemas, esta se logra a partir de la practica reflexiva.
referencia: Mendiola, Gustavo  Informática Biomédica. México D.F. Elservier 2014 
CLASE DE COMPUTACIÓN APLICADA A LA MEDICINA
(Martes 16 de agosto)
Por: Juan Alberto Gutiérrez Sendejas

En resumen en la clase se recapitulo la importancia de tener acceso a las nuevas tecnologías, dado que ahora son una herramienta fundamental en la toma de decisiones de ámbito médico, cabe mencionar en este aspecto un término que menciono el doctor Jorge Francisco Osorio Ocampo en cuanto que nosotros somos parte de la generación NET, es decir somos parte de un contexto en el que el uso de las nuevas tecnologías y el acceso a mucha información son cosas inherentes hoy en día.
No toda la información se encuentra en la computadora, existen datos que nosotros tenemos que investigar en fuentes primarias y que la usencia de algún dato también nos puede llevar a tener conclusiones. Con esto me remonto a la diferencia entre dato e información, el primero se define como la representación simbólica de algo como es el caso de los códigos y cifras, mientras que el segundo se refiere al conjunto de datos ordenados para construir un mensaje y que contribuyen a la toma de decisiones (signos vitales en un paciente)

De igual manera en clase pude observar, que la bioestadística y la computación aplicada a la medicina, tienen una estrecha relación, por ejemplo si hablamos de datos y signos vitales, estos se pueden incluir como variables cualitativas o cuantitativas según sea el caso, además de que el software en una computadora nos puede ayudar a hacer operaciones matemáticas, como el cálculo del índice de masa corporal por ejemplo.

martes, 16 de agosto de 2016

RESUMEN CAPITULO 3:
Conceptos esenciales en informática Biomédica
http://regiones.explora.cl/media/k2/items/cache/f9fbdffa6384727d050131b622ad5364_XL.jpgLas computadoras son un elemento indispensable para el desarrollo, de la informática biomédica, son la herramienta con la que esta disciplina se desarrolla, hoy en día tenemos el uso de estos medios al alcance de nuestras manos, cuando antes era imposible.
Gracias al uso de las tic´s todo se puede hacer más rápido, y es mucho más fácil obtener información, como es el caso de los expedientes electrónicos, con los que se pueden tomar fácilmente decisiones para un tratamiento efectivo, así como el ahorro de dinero.
Al hablar de computadoras es preciso hablar de Hardware y Software, es decir la estructura y funcionamiento de una computadora, si hiciéramos una analogía médica se podría decir que el hardware viene siendo la anatomía y el software la fisiología; estas dos características en una computadora nos sirven para procesar datos.
El hardware es todo aquello que se encuentra conectado y forma a la computadora en sí y se puede tocar, mientras que el software es el conjunto de instrucciones que controlan dichos circuitos y todo aquello a lo que se le denomina hardware.
El internet no es ni hardware ni software, si no la interconexión de computadoras mediantes los protocolos TCP/IP por lo tanto se le denomina red.
Es importante saber el tiempo de información que manejamos para prevenir errores en la práctica clínica sobretodo en la tomas de decisiones. El hecho de que haya una conexión entre varias personas, demanda el uso de una terminología estandarizada que se encuentra albergada en manuales aprobados por la OMS

referencia: Mendiola, Gustavo  Informática Biomédica. México D.F. Elservier 2014 

domingo, 14 de agosto de 2016

RESUMEN: Capítulo 1.
INTRODUCCIÓN A LA INFORMÁTICA BIOMÉDICA
El uso cotidiano de las computadoras y el uso de las tecnologías de la información hoy en día se consideran como cosas que son imprescindibles para vivir, en pleno siglo XXI resulta incoherente no tener acceso a estos servicios.
La medicina y su constante evolución necesitan el apoyo de las computadoras y de las tic´s, es por ello que surge la INFORMATICA BIOMÉDICA, esta disciplina no solo se reduce a computadoras y tic´s por lo que resulta difícil crear una definición amplia, que no deje fuera aspectos fundamentales. Sin embargo es conveniente tener un definición de la IB obtenida por consenso, para que de esta manera se cree la construcción eficaz de este campo del conocimiento y de igual forma dar la categoría de ciencia a la IB por varias razones conceptuales y prácticas.  
Existen varias definiciones basadas y orientadas según al que se emplee para que se ocupe, donde se ocupe y quien la ocupe, cabe mencionar que las distintas definiciones tienen cosas en común pero también dejan fuera a otras; para fines prácticos se utiliza la definición de la American Medical Informatics Association que dice: “Informática biomédica es el campo científico interdisciplinario que estudia y persigue el uso efectivo de datos, información y conocimientos biomédicos para la indagación científica, la solución de problemas y la toma de decisiones, motivada por los esfuerzos para mejoran la salud humana.

Gracias a esta ciencia es posible facilitar muchas cosa en el campo medico en todos los campos, es importante mencionar que gracias a su extensión, la IB fue aprobada como especialidad médica

referencia: Mendiola, Gustavo  Informática Biomédica. México D.F. Elservier 2014